Die praktische Arbeit im FUN ist vielfältig und wird in verschiedenen Arbeitsgruppen organisiert. Die Koordination der Gruppe und deren Arbeit wird von der Arbeitsgruppenleitung durchgeführt. Neben den Ortsgruppen, die in den jeweiligen Ortsteilen aktiv sind, gibt es Arbeitsgruppen, die sich speziellen Aufgaben wie beispielsweise der Tierhaltung oder der Instanthaltung widmen.

Jede Arbeitsgruppe ist einem Vorstandsmitglied zugeordnet – so können neue Projektideen der Gruppe sowie auftretende Fragen und Probleme schnell und unkompliziert diskutiert werden.